药材的内在质量集中表现在有效成分的含量高低上。当药用植物所处的外界环境条件发生了变化，其体内的次生代谢活动就会受到影响，从而使次生代谢成分的含量发生变化，结果影响到
药材的内在质量。
生长环境 药用植物的生长发育及产品器官的形成、有效物质的合成与积累，一方面决定于遗传特性，另一方面受其生长环境条件的直接或间接的影响。从总体上来看，环境条件包括四大方面，即气候条件、土壤条件、地形条件和生物条件。气候条件包括光照强弱、日照长短、光谱成分、温度高低及变化、水分形态、水分数量、水分蒸发量、空气、风速与雷电等；土壤条件包括土壤结构条件、有机质、地温、土壤水分、土壤养分、土壤空气和酸碱度等；地形条件包括海拔高度，地形起伏状，坡向和坡度等；生物条件包括动物因素、植物因素和微生物因素等。
药用植物在长期的生存竞争及双向选择过程中，与产地生态环境建立了相互适应的紧密联系，形成了道地药材的特性，由于环境条件与生物体之间相互匹配合适，就能保证该品种的优良特性，使其质量上乘，有效成分含量提高。如
金银花在不同产地其有效成分绿原酸含量差异极显著：山东平邑产为5.66、河南新密市为5.18、山西太谷为3.88、重庆为2.2、云南大理为1.81。这是由于药用植物外界环境条件发生了变化，其体内的次生代谢活动就会受到影响，从而使次生代谢成分的含量发生变化，最终影响药材的内在质量。
品种 药用植物的高产优质主要取决于品种本身的特性。目前各育种单位正抓紧筛选亲本材料，采用常规育种，远缘杂交、人工诱变等育种手段来培育高产优质的药材品种。
研究发现，药用植物体内有效成分的种类与含量因种类不同而相差甚远，即使同一种药用植物的不同个体之间也有较大差异。因此采取措施定向培育那些产量高且有效成分含量也高或有效成分含量变化不大、稳定性好的药用植物植株，使其形成新的栽培品种，是GAP生产中提高药材产量与质量的重要途径之一。例如，中科院药物所用野生药用齿瓣元胡与正品浙江元胡杂交，育成的杂交元胡新品种“杂交9号”综合了齿瓣元胡块茎大、生长旺盛以及家栽浙江元胡繁殖快、生物碱含量高的特点，增产效果高达62。
良种选育研究新成果也有利于药材有效成分含量的稳定和提高，如组织培养、细胞培养、快速繁殖、太空育种等。配合良法
种植的罗汉果脱毒苗植株健壮无病、长势旺、结果早、数量多、品质高，与传统压蔓
技术繁殖的普通苗相比，种后第一年结果的植株达50～70，增加近一倍，平均每株结果约30个，增加了二倍，其有效成分罗汉果甜甙的收取率则提高了5。再如曾搭载过“神舟”一号、三号等系列飞船的数十种太空药材种子，已在安国市科崴航天育种等基地播种吐绿，株壮叶茂，有望能从中筛选出符合国际标准、遗传性稳定、高效优质、抗病性强的新品种。
肥料 实践表明，合理施肥不仅能够提高药材的产量，同时还能增加药材中有效成分的含量，提升其内在品质，具体内容包括以下两个方面：
一是不同肥料对药材质量的影响。在肥料三要素中，磷与钾有利于碳水化合物与油脂等物质的合成，氮素对植物体内生物碱、甙类和维生素等，特别是生物碱的形成与积累起着重要作用。如蔓陀罗，当土壤中镁、磷、钾三者含量相等时，最有利于其叶、根中总生物碱含量的增加；锰肥可使单雄蕊蛔蒿花蕾中山道年的含量提高；通过大量施用有机肥，可使西洋参中的
人参总皂甙含量提高27.86。
二是施肥时期及施肥量对药材质量的影响。每种药用植物有效成分的合成具有各自不同的规律，不同肥料对其产生的影响也各不相同。肥料的用量过多或缺乏，药用植物有效成分含量反而下降，如适量氮肥对生物碱的合成与积累具有一定的促进作用，但过量则对其它成分如绿原酸、黄酮类等都有抑制作用。
播种期 同一品种播种时间不同，对药材的产量与质量也有重要影响。如4月份播种的荆芥，其植株生长高大，花序长而疏稀，不成穗状，药材中的挥发油含量较低；而6月份播种的荆芥植株虽然矮小，但花序短而紧凑，呈明显的穗状，药材中的挥发油含量较高。因此，选择最佳播种期也是获得高产优质药材的重要环节之一。
灌溉 灌溉对药用植物品质的影响，是通过药用植物植株对土壤水分的敏感性发生作用的，主要体现在药用植物生长发育阶段。对于一般药用植物来讲，生长环境中过多的水分对其体内有效成分的合成与积累是不利的。如麻黄，在雨季时体内生物碱的含量会急剧下降，而
